Hlavnou náplňou oddelenia klinickej mikrobiológie (OKM) je poskytovanie komplexnej mikrobiologickej diagnostiky na stanovenie etiológie mikrobiálnych ochorení a kauzálnej antiinfekčnej, prípadne imunomodulačnej terapie.
Oddelenie klinickej mikrobiológie v Košiciach má široký záber diagnostických metód a rozmanité prístrojové vybavenie, je akreditované podľa normy ISO 15 189:2012 a pravidelne vykonáva interné a externé hodnotenia kvality (LabQuality).
Podľa špecializácie a zamerania je oddelenie rozdelené na jednotlivé úseky:
• bakteriológia,
• parazitológia
(protozoológia, helmintológia),
• molekulárna biológia,
• infekčná sérológia
(bateriologická a virologická).
Na diagnostiku infekčnej etiológie možno využiť dva základné princípy: priamu identifikáciu mikroorganizmu a nepriamy dôkaz infekčnej etiológie meraním špecifických markerov infekcie v sére a tkanivách.
Priama diagnostika zahŕňa kultivačné vyšetrenie a následnú rutinnú identifikáciu mikroorganizmov. Okrem štandardných postupov (biochemické metódy) používame v laboratóriu aj najmodernejší prístroj pracujúci na báze hmotnostnej spektrofotometrie – MALDI-TOF. Prístroj výrazne zrýchľuje identifikáciu mikroorganizmov.
Na stanovenie citlivostí baktérií na antibiotiká využívame okrem celosvetovo uznávaného systému VITEK aj lokálny systém detekcie citlivostí MIC (minimálna inhibičná koncentrácia) od slovenského výrobcu MIDITECH. Ide o modifikáciu stanovenia MIC na základe aktuálnej verzie EUCAST. Systém deteguje MIC dvadsiatich antibiotík u Gram negatívnych baktérií, stafylokokov a enterokokov. Vďaka expertnému systému priamo určí mechanizmus rezistencie baktérií k antibiotikám (MRSA, ESBL, karbapenemázy...).
Súčasťou priamej diagnostiky sú aj imunochromatografické vyšetrenia vybraných vírusových ochorení a bakteriálnych antigénov a toxínov.
Pomocou metód molekulárnej biológie sme počas pandémie Covid 19 vyšetrili veľké množstvo vzoriek. Zároveň sme sa stali prvým súkromným laboratóriom na Slovensku, ktoré akreditovalo PCR metódu na vyšetrenie SARS-CoV-2.
Rovnako sa venujeme aj genotypizácii HCV a stanovenie hladín virémie u HBV a CMV. Pomocou metód molekulárnej biológie diagnostikujeme aj rozsiahly panel pohlavne prenosných ochorení (STD).
Kompletná parazitologická diagnostika u nás zahŕňa nielen makroskopické a mikroskopické vyšetrenie protozoí a helmintov, ale je doplnená aj o sérológické vyšetrenia tkanivových parazitov.
V rámci nepriamej diagnostiky je sérológická diagnostika infekčných ochorení v centre záujmu vzhľadom na významné rozšírenie v praxi využívaných moderných automatizovaných vyšetrovacích systémov a modulov.
Zaviedli sme plne automatizovaný ELISA prístroj EUROLAB WORKSTATION na vyšetrenie respiračných ochorení a iných vybraných patogénov. Rovnako využívame aj imunosérologické analyzátory na princípe chemiluminiscencie – CLIA.
Okrem diagnostickej činnosti, ktorú vykonávame pre nemocničné zariadenia a ambulantných lekárov, realizujeme v laboratóriu aj vzdelávanie a prax pre budúcich laborantov a laboratórnych diagnostikov.
Pre klientov poskytujeme odborné konzultácie, hodnotenia laboratórnych výsledkov a prehľady antibiotickej rezistencie.
Úlohou mikrobiologického laboratória je poskytnúť lekárom dôležité informácie vedúce k pochopeniu patogenézy ochorenia na základe charakteristík mikroorganizmov a tým pomôcť pri výbere správnej terapie.
MVDr. Nataša Šályová
Vedúca košického laboratória
SYNLABu a kolektív
MVDr. Nataša Šályová - vedúca laboratória v Košiciach
Bakteriologické laboratórium v Košiciach
Očkovanie na diagnostické pôdy